Technologie-Plattform

Mikroskopie

Teilprojektpartner TP1

Konfokalmikroskop Elyra PS.1

Konfokalmikroskop Elyra PS.1 (Carl Zeiss Microscopy GmbH), ausgestattet mit einer Superresolutioneinheit

Konfokale Mikroskopie, Auflösung: 250 nm
Structured illumination microscopy (SIM), Auflösung: 120-150 nm
Photoactivation localization microscopy (PALM), Auflösung: 25 nm

Laser: 405, 488, 518, 561, 594, 633 nm
Live cell imaging: CO2-Versorgung, 37 °C

Ansprechpartner:
Dr. rer. nat. Heiko Lemcke
Wissenschaftlicher Mitarbeiter TP1
E-Mail: heiko.lemcke(at)med.uni-rostock.de
Tel.: +49 (0) 381 - 494 6049

MEA

Teilprojektpartner TP1

Microelectrode array (MEA) MEA2100 -Systems

Multi- / Mikroelektrodenarray (MEA) -Systeme bieten eine nicht-invasive benutzerfreundliche Plattform für die detaillierte elektrophysiologische Analyse von iPSC-Kardiomyozyten, einschließlich Medikamententestung zur Identifizierung potenzieller therapeutischer Ziele und zur Bewertung des proarrhythmischen Risikos. Es kann eine Ableitung des Feldpotenzials bei spontan aktiven Zellen durchgeführt werden. Des Weiteren können Zellen einer elektrischen Stimulation unterzogen werden. Langzeitmessungen werden durch ein Heizsystem und eine Medienzirkulation ermöglicht.

Ansprechpartner:
M. Sc. Sophie Kussauer
Doktorandin TP1
E-Mail: sophie.kussauer(at)med.uni-rostock.de
Tel.: +49 (0) 381 - 498 - 8972

Patch Clamp

Teilprojektpartner TP2

CytoPatch^TM2- automatisiertes Patch Clamp

Automatisierte und standardisierte Abläufe
Dokumentation direkt
Validierungen somit möglich
Kontrollierte Umgebung (Temp, Druck, …)

Ansprechpartner:
Dr. rer. nat. Julien Soós
Wissenschaftlicher Mitarbeiter TP2
E-Mail: julien.soos(at)med.uni-greifswald.de
Tel.: +49 (0) 3834 86 - 8132
Mehr Informationen auf der Webseite

Die Vector-Core-Facility

Teilprojektpartner TP3

Virale Vektor und Genom-Editing Technologien

Die Vektor-Core-Facility am IEGT unterstützt Forscher aus dem Bereich der regenerativen Medizin, translationaler Medizin, sowie Immunotherapie. Mehr können Sie aus dem Portfolio erfahren oder kontaktieren Sie uns direkt.

Ansprechpartner:

Teilprojektleiterin TP3
Prof. Dr. med. Dr. rer. nat. Brigitte M. Pützer

Sekretariat:
E-Mail: ingrid.winkler(at)med.uni-rostock.de
Tel.: +49 (0) 381 494 - 5066
Mehr Informationen auf der Webseite

Bioinformatik

Teilprojektpartner TP4

Omics Dataintegrationskonzepte in der Systemmedizin

Herr Wolfien unterstützt experimentelle Forschung und entwickelt flexible Arbeitsabläufe für die computergestützte Analyse von Daten mit niedrigem und hohem Durchsatz wie beispielsweise Blutmessungen, Proteinexpression sowie RNA-Sequenzierungsdaten und integriert diese mit weiteren Informationen

Ansprechpartner:
M. Sc. Markus Wolfien

Doktorand TP4
E-Mail: markus.wolfien(at)uni-rostock.de
Tel.: +49 (0) 381 498 - 7577
Mehr Informationen auf der Webseite

Next-Generation-Sequencing

Teilprojektpartner TP5

Sequenzierung (HiSeq2500, Illumina) inklusive Single Cell Sequencing (10x Chromium Controller)

Wir betreiben einen Illumia HiSeq2500 von Illumina. Mit dieser Plattform sind bis zu 8 Mrd reads, das entspricht 0,9-1 Tb Basen Output in 6 Tagen möglich (HiSeq SBS v4; paired end 2x125 b, dual flow cell). Dies hängt von den eingesetzten Protokollen ab.
Zusätzlich verfügen wir über die Möglichkeit single cell libraries mit unserem 10x Chromium System zu erstellen und zu sequenzieren.
Wir bieten die Sequenzierung von DNA, RNA sowie des mikrobiellen 16s-Metagenoms an. Unser Service erstreckt sich auf folgende etablierte Sequenzierungsmethoden:

RNA-Seq (Gesamt-RNA, mRNA, Depletionsprotokolle)
miRNA-Seq
ChIP-Seq
DNA methylation sequencing (RRBS und WGBS)
16S/18S-Seq metagenome

Ansprechpartner:
Dr. Ronald Brunner
Wissenschaftlicher Mitarbeiter TP5
E-Mail: brunner(at)fbn-dummerstorf.de
Tel.: +49 (0) 382 086 - 8734

Dr. Nares Trakooljul
Servicegruppenleitung
E-Mail: trakooljul(at)fbn-dummerstorf.de
Tel.: +49 (0) 382 086 - 8726
Mehr Informationen auf der Webseite